ステム-ループ
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RNAはDNAより構造が柔軟で、分子内で短い塩基対や非典型的塩基対(e.g. GとUの塩基対)をつくりやすく、結果として多くのステム-ループ構造が形成され、分子全体が球状に折りたたまれやすい(tRNAがよい例) ステムループは、同じ鎖の2つの領域、通常は相補的なヌクレオチド配列を持つ領域が塩基対形成によって二重らせん(ステム)を形成したものであり、ステムの末端には対合していないループ領域が存在する。