塩基多様度
複数の
塩基配列
間にどのような多様性があるかを測る指標の一つ
塩基多様度は二つのサンプルを集団からランダムに選んだ際に観察される、サイトあたりの違いの
平均値
$ N
を
有効集団サイズ
、
$ \mu
を世代あたりサイトあたりの
突然変異率
とすると、有効集団サイズが一定の
ライト-フィッシャー集団
では、塩基多様度
$ \pi
について
$ \pi=4N\mu=\theta
という関係式が成り立つ