AlphaFold
...2022年、革新的なAlphaFoldニューラルネットワークを駆使して、ゲノム塩基配列が知られている生物の既知のタンパク質の構造をほぼ全て予測し、約2億1400万件のエントリーからなるデータベースを構築した。 このデータベースは欧州バイオインフォマティクス研究所(英国ヒンクストン)が管理していて、誰でも自由に利用できる。
今回、この情報資源を活用した2つの研究によって、遠縁のタンパク質間の予想外の構造的関連や、全く新しい構造など、数年前には想像もできなかったような知見が得られた1,2。
Alphafold 2の論文
https://gyazo.com/bd8ba2b4396406fce87a644ca58225c7
...6年間解けなかったアシメ12分子(超?)の結晶構造がMOLREPであっさり解けました。。すごすぎ。
今までモデリングしてもらったので色々MRかけてきましたが全部だめでした。アシメの分子数が大きいから、と思ってたけど、ちゃんとしたモデル使えばいけるんですね。
Publishについては分かりません。もはやこれだけで論文をpublishすることにほとんど意味がないことは直感的にわかります。
もともとモデリングってかなりいいところまで来てたんですけど、ほぼ同じものが出てくる感じ。なのでその後何するかですよね。酵素の場合は活性部位がちゃんとしてるかどうかが大事なんですけど。
今後Seの廃液処理は減りそうです。