ショートカットキーの設定から項目が消えた
プラグインによるショートカットキーの追加の上限数は256個となっています
ショートカット追加プラグインなど多く追加されるものを入れている場合、上限に達してしまってそれ以降追加されないという事が起こります。
対策
sub_menu_itemというプラグインで不要な項目を消す