Py3DMolでpLDDTカラーリング

code:plddt_color.py

import py3Dmol

view = py3Dmol.view(width=800, height=600)

view.addModel(open(pdb_file).read(), 'pdb')

view.setStyle({}, {'cartoon': {}})

for rng, col in bins:

view.setStyle({'b': rng}, {'cartoon': {'color': col}})

view.setBackgroundColor('white')

view.zoomTo()

view.show()