Hauri DC 1995
Hauri DC, Ross J. A model of excitation and adaptation in bacterial chemotaxis. Biophys J. 1995 Feb;68(2):708-22. doi: 10.1016/S0006-3495(95)80232-8. PMID: 7696522; PMCID: PMC1281735. 使えるかもしれない
私たちは、大腸菌の化学走性メカニズムのモデルを提案します。このモデルは、刺激のあらゆるレベルに対して初期の興奮を示し、最終的に完全な適応を達成する(「正確な」適応)特性を有しています。反応ネットワークを構築する際、既知の相互作用と実験的に決定された細胞質濃度のみを使用します。可能な限り、反応速度定数はまず実験的に測定された値を割り当てます。次に、複数ウェル最適化技術と段階的な調整を用いることで、これらの反応速度定数に一定の変動を許容し、刺激に対する初期応答(興奮)と最終的な行動の基線への復帰(適応)を引き起こすのに十分な値を得ます。モデルの予測は、誘引物質と忌避物質の両方が存在する場合の野生型細菌の興奮の時間スケールに関して、観察された行動と類似しています。モデルは実験的に観測されたものよりも誘引物質に対する応答が弱く、適応の時間スケールは刺激物質濃度への依存性が野生型細菌ほど強くないことを予測します。長期適応のメカニズムは局所的であり、全球的ではありません:忌避物質または誘引物質が添加されると、その誘引物質または忌避物質に感受性のない受容体タイプは、一時的な変化は生じても、長期的に平均メチル化レベルを変えません。細菌の化学走性に関する現象論的シミュレーションを実施した結果、モデルは誘因物質の濃度勾配における効果走性に十分に敏感ではありません。しかし、モーターのタンブル効果器(リン酸化CheY)に対する感度を任意に増加させることで、化学走性行動を得ることができます。