プロジェクト・タスク・サブタスクをただのアウトラインとして扱う

OmniFocusに触れていると上記のように感じます。

逆に言うと、OmniFocusではプロジェクト・タスク（・サブタスク）はただのアウトラインとしてぐらいにしか扱えない

プロジェクト管理ならば「もっと機能を付けて欲しい」となるところですが（そうした向きにはOmniPlanというツールがありますが）、OmniFocusぐらいのプロジェクトをアウトラインとして扱うぐらいが個人でやるタスク管理にはちょうどいいようにも思えます。

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リストの中に風景としてなってしまったら

私の場合、そのまま忘れてしまえるように、消えてしまうシステムが良いのではないかと、最近考えています。

タイトルだけ起こしておきますね

そうでなくても忘れてしまっているものが多そうです。