Bonsai-scout

https://scrapbox.io/files/68205b755ed572acf187c9d4.png

o3.icon

Bonsaiのアルゴリズムを用いて、ユーザーが樹状図を自由に探索できる対話型ビジュアライゼーションツール

高次元データを損失なく簡潔な樹形図にまとめ上げる点で画期的

ビジュアル面の特徴

任意の部分（サブクレード）を選択してその下位構造にズームインし、当該クレードを特徴付ける遺伝子や特徴量を自動抽出できる

樹全体のレイアウトを変更できる

特定の特徴（遺伝子発現量など）を枝に沿って色分け表示できる

→「どのデータ点がどの枝に属するか」「クラスタがどのように細分化されるか」を体感可能

cf.

セルビューア（DBKERO）

日本のデータベース研究者によるシングルセルビューア（DBKERO）の取り組みでも、ユーザーが時系列データや位置情報をインタラクティブに体感できる点をショーケースとして強調しています

Heatのポスト

@heat_1nt: 構造を用いて高次元データをほぼ歪みなく可視化・解析できる新手法 “Bonsai“

https://scrapbox.io/files/68204e33458219a428a433e7.png