Power Queryで、データの全更新を二度しないとデータがきちんと更新されないことがあるのは何故か

①読み込んだ（インポートした）データを一度Excelシートに読み込んで、②そのシートをクエリから参照していると、①→②の順序は保証されずに②→①などの順番で処理されることがある

これが原因のことが多いらしい

対処法

Excelシートに読み込まずに、すべてクエリ間の処理にする

クエリの依存関係を確認しましょう

言い換えると、データソースの設定で、「現在のブック」が存在していると黄色信号です

絶対にこれが原因とは主張しませんが、一つの可能性として上記を調べてみてください