MCMC using Turing with Julia, JuliaStan
#Ubuntu #PCsettings #Julia #7_DataAnalysis #Turing
Aim
Julia で Turing をつかって MCMC
参考1 Julia で階層ベイズ
参考2 Julia で WAIC は LOOCV を計算する方法
準備
Turing は pkg mode で add Turing で OK
Turing の使い方は，黒木さんのこの辺でざっくり
CmdStan (のGitHub レポジトリ．Pystan, Rstan もこのあたりから）
Stanのオフィシャルページ
各インターフェース
[CmdStan https://mc-stan.org/users/interfaces/cmdstan.html，リリース版
Stan の Install
インストール方法
Official のダウンロード から
Current stable release: v1.8.2（September 29, 2022) をの 64-bit(glibc)を選択して
cd ~/Downloads
wget https://julialang-s3.julialang.org/bin/linux/x64/1.8/julia-1.8.2-linux-x86_64.tar.gz
tar.gz を展開 tar -zxvf julia-1.8.2-linux-x86_64.tar.gz
sudo mv ~/Downloads/julia-1.8.2/ /opt/
Setting: Terminal から 呼び出し
/usr/local/bin/julia にシンボリックリンクをはる．
古い version の Julia からアップグレードする場合は
sudo unlink /usr/local/bin/julia でリンクを外す
リンクし直す
sudo ln -s /opt/julia-1.8.2/bin/julia /usr/local/bin/julia
Date :
Modified Date :2023/9/15
Author :lattice.icon