Linuxでメニューなどを開いた状態のスクリーンショットを撮るには
コマンドラインからスクリーンショットのコマンドを遅延時間指定で実行し、その間にGUI操作するしかないらしい。
参考：ubuntuでプルダウンメニューなど開いた状態で画面キャプチャできない対策｜若林たかゆき