Weibullモデルへのフィッティング (速度論モデル)

Weibullモデルへのフィッティングの仕方がわからないとの声を多くいただくので、簡単なものですが作成したので共有してみようと思います。

・平均値、標準偏差を計算してある場合 Weibull fitting (curve_fit).ipynb

https://colab.research.google.com/github/Hiroki-Abe/Weibull_curve_fit/blob/main/Weibull%20fitting/Weibull%20fitting%20(curve_fit).ipynb

・平均値、標準偏差を計算していない場合 Weibull fitting (curve_fit) No S.D. data.ipynb

https://colab.research.google.com/github/Hiroki-Abe/Weibull_curve_fit/blob/main/Weibull%20fitting/Weibull%20fitting%20(curve_fit)%20No%20S.D.%20data.ipynb

適宜、変更等行い、ご自由にお使い下さい。（2023/05/24）

↓　Githubリンク

https://github.com/Hiroki-Abe/Weibull_curve_fit

フィッティング例

https://scrapbox.io/files/64670094102da1001c85f53a.png

例題用データは以下の論文から引用

Koyama, K., Ranta, J., Takeoka, K., Abe, H. & Koseki, S. Evaluation of strain variability in inactivation of Campylobacter jejuni in simulated gastric fluid by using hierarchical bayesian modeling. Appl Environ Microb 87, e00918-21 (2021).